Identification et Quantification de métabolites dans un spectre RMN

Résumé

Nous nous intéressons ici à un problème rencontré en métabolomique. Ce domaine vise à caractériser la composition d'un mélange complexe par ses métabolites i.e. ses petites molécules. Les spectromètres RMN fournissent un spectre de mélange complexe qui est la superposition des spectres des métabolites purs. Chaque métabolite possède un spectre caractéristique, sa signature, qui le rend identifiable. Cependant, la reconnaissance automatique des métabolites dans un mélange complexe est rendu délicate par des problèmes comme la déformation du spectre (translation, dilatation ...) ou la superposition des pics. Nous proposons ici une méthode permettant d'identifier et de quantifier rapidement les métabolites dans un spectre complexe. Nous estimons tout d'abord les déformations à l'aide d'une procédure itérative puis nous calculons les proportions des métabolites de manière simultanée en utilisant un algorithme de programmation linéaire ou une méthode type LASSO. Cette procédure est ensuite testée sur différentes données réelles générées par la plateforme AXIOM de l'UMR Toxalim.